Az UEFA-kupa 2005-2006-ös szezonjának pontos menetrendje és eredményei, az első selejtező körtől egészen a 2006. május 10-i döntőig.
| 2. selejtezőkör, 1. mérkőzések: | |||
| FC Sopron | - | Metalurg Doneck (ukrán) | 0-3 |
| Szamara (orosz) | - | BATE Boriszov (fehérorosz) | 2-0 |
| Banantsz Jereván (örmény) | - | Dnipro (ukrán) | 2-4 |
| MTZ-RIPO Minszk (belorusz) | - | Teplice (cseh) | 1-1 |
| Nistru Otaci (moldovai) | - | Grazer AK (osztrák) | 0-2 |
| Inter Zapresic (horvát) | - | Crvena zvezda (szerb) | 1-3 |
| OFK Beograd (szerb) | - | Lokomotiv Plovdiv (bolgár) | 2-1 |
| Asdod (izraeli) | - | Domzale (szlovén) | 2-2 |
| Midtjylland (dán) | - | B36 Torshavn (feröeri) | 2-1 |
| Groclin Grodzisk (lengyel) | - | Dukla Banka Bystrica (szlovák) | 4-1 |
| Metalurgs Liepaja (lett) | - | Racing Genk (belga) | 2-3 |
| Rapid Bucuresti (román) | - | Vardar (macedón) | 3-0 |
| Djurgarden (svéd) | - | Cork City (ír) | 1-1 |
| Halmstad (svéd) | - | Linfield (északír) | 1-1 |
| Esbjerg (dán) | - | Tromsö (norvég) | 0-1 |
| Brann Bergen (norvég) | - | Allianssi (finn) | 0-0 |
| Grasshoppers (svájci) | - | Wisla Plock (lengyel) | 1-0 |
| MyPa (finn) | - | Dundee United (skót) | 0-0 |
| FC Vaduz (liechtensteini) | - | Besiktas (török) | 0-1 |
| Litex Lovecs (bolgár) | - | Rijeka (horvát) | 1-0 |
| APOEL (ciprusi) | - | Maccabi Tel Aviv (izraeli) | 1-0 |
| Bashkimi (macedón) | - | Maccabi Petah Tikva (izraeli) | 0-5 |
| Rhyl (walesi) | - | Viking Stavanger (norvég) | 0-1 |
| Legia Warsawa (lengyel) | - | FC Zürich (svájci) | 0-1 |
| Zeta Golubovci (szerb) | - | Siroki Brijeg (bosnyák) | 0-1 |
| Zilina (szlovák) | - | Austria Wien (osztrák) | 1-2 |
| FC Köbenhavn (dán) | - | Carmarthen (walesi) | 2-0 |
| FSV Mainz (német) | - | IBK (izlandi) | 2-0 |
| Publikum Celje (szlovén) | - | Levszki Szófia (bolgár) | 1-0 |
| Dinamo Bucuresti (román) | - | Omonia Nicosia (ciprusi) | 3-1 |
| Pasching (osztrák) | - | Zenit (orosz) | 2-2 |
| 2. selejtezőkör, visszavágók: | |||
| Metalurg Donyeck (ukrán) | - | FC Sopron | 2-1 |
| BATE Boriszov (fehérorosz) | - | Szamara (orosz) | 0-2 |
| Dnipro (ukrán) | - | Banantsz Jereván (örmény) | 4-0 |
| Teplice (cseh) | - | MTZ-RIPO Minszk (belorusz) | 2-1 |
| Grazer AK (osztrák) | - | Nistru Otaci (moldovai) | 1-0 |
| Crvena zvezda (szerb) | - | Inter Zapresic (horvát) | 4-0 |
| Lokomotiv Plovdiv (bolgár) | - | OFK Beograd (szerb) | 1-0 |
| Domzale (szlovén) | - | Asdod (izraeli) | 1-1 |
| B36 Torshavn (feröeri) | - | Midtjylland (dán) | 2-2 |
| Dukla Banka Bystrica (szlovák) | - | Groclin Grodzisk (lengyel) | 0-0 |
| Racing Genk (belga) | - | Metalurgs Liepaja (lett) | 3-0 |
| Vardar (macedón) | - | Rapid Bucuresti (román) | 1-1 |
| Cork City (ír) | - | Djurgarden (svéd) | 0-0 |
| Linfield (északír) | - | Halmstad (svéd) | 2-4 |
| Tromsö (norvég) | - | Esbjerg (dán) | 0-1 |
| Allianssi (finn) | - | Brann Bergen (norvég) | 0-2 |
| Wisla Plock (lengyel) | - | Grasshoppers (svájci) | 3-2 |
| Dundee United (skót) | - | MyPa (finn) | 2-2 |
| Besiktas (török) | - | FC Vaduz (liechtensteini) | 5-1 |
| Rijeka (horvát) | - | Litex Lovecs (bolgár) | 2-1 |
| Maccabi Tel Aviv (izraeli) | - | APOEL (ciprusi) | 2-2 |
| Maccabi Petah Tikva (izraeli) | - | Bashkimi (macedón) | 6-0 |
| Viking Stavanger (norvég) | - | Rhyl (walesi) | 2-1 |
| FC Zürich (svájci) | - | Legia Warsawa (lengyel) | 4-1 |
| Siroki Brijeg (bosnyák) | Zeta Golubovci (szerb) | 4-2 | |
| Austria Wien (osztrák) | - | Zilina (szlovák) | 2-2 |
| Carmarthen (walesi) | - | FC Köbenhavn (dán) | 0-2 |
| IBK (izlandi) | - | FSV Mainz (német) | 0-2 |
| Levszki Szófia (bolgár) | - | Publikum Celje (szlovén) | 3-0 |
| Omonia Nicosia (ciprusi) | - | Dinamo Bucuresti (román) | 2-1 |
| Zenit (orosz) | - | Pasching (osztrák) | 1-1 |