Villarreal (spanyol) - FC Brno (cseh) 2-0 (1-0)
továbbjutott: a Villareal, 3-1-es összesítéssel
Koper (szlovén) - Heerenveen (holland) 1-0 (1-0)
tj: a Heerenveen, 2-1-es összesítéssel
Vfl Wolfsburg (német) - Cibalia (horvát) 4-0 (1-0)
tj: Vfl Wolfsburg, 8-1-es összesítéssel
Slovan Liberec (cseh) - Schalke 04 (német) 0-0
tj: Schalke 04, 2-1-es összesítéssel
Werder Bremen (német) - SV Pasching (osztrák) 1-1 (1-0)
tj: SV Pasching, 5-1-es összesítéssel
Perugia (olasz) - Nantes (francia) 0-0
tj: Perugia, 1-0-s összesítéssel
A sorozat legjobb három együttese csatlakozik az UEFA-kupához.