Ha ellessük az élő szervezetekben évmilliárdok óta jelen lévő fehérje alapú nanotechnológiát, egyebek között szike nélkül "megjavíthatjuk" az ember szervezetét, vagy akár programvezérelt molekuláris összeszerelő rendszereket építhetünk. A fehérje alapú gépezetekről, az építkezés filozófiájáról beszélgetünk Vonderviszt Ferenc biofizikussal.
Mit értsünk fehérje alapú gépezeten? És közülük melyek azok, amelyek kutatásának homlokterében állnak?
Hogyan épül fel egy ilyen bonyolult rendszer?
- A motor és a külső flagelláris struktúrák önszerveződő rendszerek, tehát alkatrészeikből spontán módon összeállnak. Amennyiben a megfelelő fehérjéket a helyes sorrendet tartva egymáshoz adjuk, akkor az egyes részegységek "maguktól" felépülnek. "Megismerik egymást" az alkatrészek, kialakul a struktúra "magától". Ez olyan, mintha egy autó alkatrészeit betennénk egy nagy zsákba, kicsit összeráznánk, s összeállna a működőképes autó.
Miként lehetséges az önszerveződés?
- Egy fehérjemolekula általában több tízezer atomból áll. Gömbszerű felszínén sok jellegzetes régió található, ezek kötőhelyként szolgálhatnak más molekulák számára. Az összeilleszkedést nem feltétlen csak a felszíni formák illeszkedése szolgálja, hanem a kölcsönhatási mintázatok is meghatározóak (egymást vonzó ellentétes töltések, hidrogénhíd képző partnerek, stb.). Egy-egy fehérjéhez - minthogy a felszíne viszonylag nagy - több "partner" is kapcsolódhat. A leendő partnerek találkozását a véletlenszerű hőmozgás biztosítja. A molekulák másodpercenként több milliárd téralakzatot "próbálnak ki", ennyi változat bőven elég ahhoz, hogy az egymáshoz illő molekulák egymásra találjanak, és egymáshoz kapcsolódjanak.
Az önszerveződésnek vannak bonyolultabb szintjei is?
- Eddig viszonylag egyszerű - fehérjéken vagy fehérjék komplexumain alapuló - rendszerekről beszéltem. De vannak egészen hihetetlen tulajdonságú rendszerek is, ilyenek a riboszómák: "a programvezérelt összeszerelők". A riboszómákban történik a fehérjék szintézise. A riboszómák három hatalmas ribonukleinsav (RNS) molekulából állnak, amelyekhez több mint ötven különféle fehérjekomponens kapcsolódik. Ez az óriási molekulaegyüttes ugyancsak önszerveződés révén jön létre, s egy kémcsőben magunk is előállíthatjuk, ha megfelelő sorrendben adogatjuk a komponenseket. Fantasztikus, hogy mire képes ez a molekularendszer. Ha például a hírvivő RNS információt hoz a DNS egy darabjáról, a riboszómák az információ alapján legyártják a "megrendelt" fehérjét.
Tudjuk ezt utánozni?
- Őszintén szólva ettől még nagyon távol vagyunk. De az élő szervezetekben működő molekuláris gépezeteket megismerve kidolgozhatjuk a mi saját fehérje alapú nanotechnológiánkat. S elvileg mindazt létrehozhatjuk, amit az élő szervezetekben megcsodálhatunk. Sőt, talán még annál többet is!
Milyen úton haladva érthetünk célba?
- Az első lépés: értsük meg pontosan, hogy mi zajlik az élő szervezetekben! Ismerjünk meg minél több molekuláris gépezetet, derítsük fel a szerkezetüket, lessük el az alkalmazott trükköket, s próbáljunk belőlük tanulni! Az első szakasz már bő harminc éve megkezdődött. Fehérjeszerkezetet először a hatvanas évek közepén határoztak meg. Manapság több mint húszezer fehérjének ismerjük a felépítését, bár ezek között különböző élőlényekből származó rokon fehérjék nagy számban találhatók. Egy emberben nagyjában negyvenezer-ötvenezer különböző fehérje lehet, vagyis rengeteg munka áll még előttünk. Mindenesetre a már megismert húszezer fehérje is kellő alapot adhat a törvényszerűségek kereséséhez.
Ha már elég sokat tudunk a fehérjékről, megpróbálhatjuk azokat módosítani, hogy ne egészen azt tegyék, ami a feladatuk a természetben, hanem inkább azt, amit mi szeretnénk. Ezzel foglalkozik a fehérjemérnökség. Hogy egy példát is említsünk: a mosóporokban lévő enzimek általában természetes eredetű fehérjék. Ha azt szeretnénk, hogy egy mosópor 90 Celsius-fokon és erősen lúgos közegben is használható legyen, akkor az eredeti fehérje hőstabilitását és pH-tűrését meg kell növelnünk. Erre ma már képesek vagyunk. A génsebészet segítségével egy fehérje aminosavsorrendjét tetszés szerint átalakíthatjuk, s ezáltal a fehérje szerkezetében célzott változásokat idézhetünk elő.
A riboszóma 30S és 50S alegységeinek szerkezete. A 30S és 50S alegységekből álló riboszómák végzik a fehérjék szintézisét. Összesen három hatalmas RNS láncból (szürke) és több mint ötven különféle fehérje komponensből (színes) épülnek fel. A riboszómák a hírvivő RNS molekulák nukleotid-sorrendjében kódolt program által vezérelt összeszerelő rendszerek. Forrás: http://www.weizmann.ac.il/Structural_Biology/Pages/Yonath