A gazdaság csökkenését elsősorban az okozta, hogy a tokiói kormány októbertől tíz százalékra emelte az addig nyolc százalékos általános forgalmi adót, ami visszavetette a fogyasztást.
Szakértők jóval kisebb, 3,7 százalékos negyedéves gazdasági zsugorodásra számítottak.
A magánfogyasztás, ami a japán GDP közel 60 százalékáért felel, 2,9 százalékkal esett a tavalyi utolsó három hónapban, felülmúlva az elemzői várakozások átlagában szerepelt két százalékos visszaesést.
A tőkebefektetések 3,7 százalékkal csökkentek a negyedévben, nagyobb mértékben a szakértők által várt 1,6 százalékos esésnél.
A japán kormány azzal számol, hogy a folyó negyedévben is zsugorodhat a gazdaság, ami részben már a koronavírus okozta hatásokra vezethető vissza.